EN 百年生科 内网 新内网

检测到您当前使用浏览器版本过于老旧,会导致无法正常浏览网站;请您使用电脑里的其他浏览器如:360、QQ、搜狗浏览器的极速模式浏览,或者使用谷歌、火狐等浏览器。

下载Firefox

eLife | 陆剑课题组揭示uORF在动物进化与发育中发挥“翻译减震器”调控作用的新机制

日期: 2025-06-07

在生物体的演化和发育过程中,尽管内外环境不断变化,许多关键蛋白的表达水平却能保持稳定。这种稳定性对于胚胎发育和细胞功能维持至关重要——一旦失控,可能导致严重的发育异常或疾病。长期以来科学界观察到的转录组易变、蛋白质组稳定这一现象提示,在翻译或翻译后调控层面可能存在某种尚未阐明的机制。

2025年6月6日,W88优德官网、核糖核酸北京研究中心陆剑课题组在eLife杂志在线发表了题为“Upstream open reading frames buffer translational variability during Drosophila evolution and development”的研究论文,揭示了5' 非翻译区(5' UTR)内的上游开放阅读框(Upstream Open Reading Frames,uORFs)在维持翻译稳定性中的关键作用。研究发现,这些广泛分布于真核生物mRNA 5' UTR的顺式调控元件在mRNA翻译过程中能够发挥“减震器作用,缓冲下游编码序列(CDS)编码的主要蛋白产量在翻译过程中的波动,从而在演化与发育过程中稳定蛋白质表达,构成了一种重要的翻译层面稳态调控机制。

本研究首先借助基于TASEP框架构建的翻译模拟系统,系统评估了uORFs在不同条件下对CDS翻译波动的缓冲能力(图 1A)。模拟结果显示,uORFs翻译越强、长度越长,或数量越多,其对下游翻译波动的缓冲作用越显著(图 1B、C)。该“翻译缓冲”机制使基因在面对内外扰动时能够维持翻译层面的稳定性。

图 1 基于TASEP框架构建的翻译模拟系统。(A) 模型设置及参数;(B) 不同 uORF 起始翻译效率和 CDS 起始翻译效率的参数组合下,CDS翻译波动大小(CV)的测量;(C)不同 uORF 长度和 CDS 起始翻译效率的参数组合下,CDS翻译波动大小(CV)的测量

为验证这一模拟结果,作者比较了两个果蝇近缘种——黑腹果蝇Drosophila melanogaster和拟果蝇Drosophila simulans——在多个发育阶段的转录组与翻译组数据,发现uORFs在跨物种及发育进程中都发挥了显著的翻译缓冲作用:有uORF的基因比没有uORF的基因在翻译层面波动更小(图 2A、B)。更为重要的是,这种翻译稳态机制不仅适用于果蝇,在灵长类的跨物种比较以及人类不同个体之间也观察到了类似的uORF缓冲效应,提示该现象可能在更广泛的生物系统中保守存在。这种保守而动态的调节机制,可能是蛋白质表达在演化中维持稳定性的关键因素之一。

为进一步验证uORF“翻译缓冲”作用的生物学意义,研究团队筛选出在数据中展现出强烈的翻译缓冲特性的基因,最终关注到母源基因 bicoidbcd)。利用CRISPR技术删除其5' UTR中的uORF后(图 2C),研究人员观察到果蝇胚胎期bcd基因翻译严重失调,并出现显著的繁殖力下降(图 2D、E),这进一步印证了uORFs在调控翻译稳定性中的生理功能。

图 2 uORF 缓冲果蝇演化和发育中的 CDS 的翻译波动。(A) uORF保守性及主导性对 缓冲翻译波动的影响(B) 果蝇发育过程中,uORF 对CDS翻译波动的缓冲;(C)CRISPR-Cas9敲除bcd uORF;(D)bcd uORF删除后导致翻译异常升高;(E)bcd uORF删除后导致果蝇后代数目减少

本研究系统性地构建了uORF在发育与演化过程中稳定翻译表达的理论模型与实验证据,拓展了人们对uORF传统功能的认知。uORFs不仅是经典意义上的“翻译抑制因子”,用于限制蛋白过量表达,更是一种“翻译减震器”,通过缓冲内在噪声,在维持基因表达稳态和表型稳健性方面发挥着深远作用(图 3)。随着相关研究的不断深入,uORFs在代谢调控、应激响应乃至疾病易感性中的潜在功能正逐渐被深入揭示。这些隐藏于“翻译密码”中的调控元件,或许正是揭示复杂生命稳态机制的关键线索。

图 3 uORF 调控翻译的”双重角色”示意图

W88优德官网及核糖核酸北京研究中心陆剑教授为该论文的通讯作者,W88优德官网已毕业博士研究生孙元强(现山东第一医科大学附属皮肤病医院博士后)、已出站博士后段元格(现中国农业大学副教授)为该论文的共同第一作者。W88优德官网院研究生高培翔、刘晨露、靳垲淳、汤文雄、W88优德官网已毕业博士研究生窦圣乾(现山东第一医科大学附属眼科研究所副研究员)、已出站博士后张宏(现兰州大学生态学院教授)也为此项研究作出重要贡献。

原文链接:https://doi.org/10.7554/eLife.104074.3